Em 1754, o fundador da Venerável Irmandade de Nossa Senhora da Lapa, Padre Ângelo Sequeira, foi convidado pelo governador de armas do Porto, D. Diogo de Sousa, a visitar a cidade. Na sua visita decidiu construir uma capela em honra de Nossa Senhora da Lapa. Essa capela ergue-se, em 1755, num local ermo no “Padrão velho, na raiz do monte de S. Ovídio”. Um ano mais tarde, a 17 de julho, pela grande abundância de fiéis, lança-se a primeira pedra da nova igreja, construção que se arrastou até 1863. O seu primeiro projeto foi encomendado a João Glama Ströberle, porém um novo desenho foi encomendado a José de Figueiredo Seixas, arquiteto que dirigiu as obras até 1773, data da sua morte.

No dia 5 de maio de 1799, quando o corpo da igreja se dá por terminando, realizou-se o rito da dedicação. É desde essa altura que a Irmandade da Lapa celebra a festa da padroeira, no primeiro domingo de maio.

Com a igreja construída o olhar virou-se para o interior da igreja da Lapa, onde ainda hoje se pode ver trabalhos de diferentes artistas e artesãos. O altar-mor do entalhador portuense Manuel Moreira da Silva e a sua pintura de Joaquim Rafael, o presépio miniatura da escola Machado de Castro e o simulacri da relíquia de Santa Vitória.

No seu interior pode-se ainda ver o mausoléu onde repousa, desde 1837, o coração de D. Pedro IV. Um monumento do “mais fino granito que se pôde extrair das pedreiras da cidade”, concebido e projetado por Joaquim da Costa Lima Júnior.

Num passado mais recente, a Casa da Irmandade e a Galeria dos Retratos. Da autoria do arquiteto portuense Marques da Silva (1869-1947) o edifício contíguo à igreja acolheu também, até 2008, a Escola da Lapa.